Niccolò Ottone è nato a Genova, il 6 giugno 1818, da Stefano Ottone e da Isabella Giudici, altrimenti detta Elisabetta Giudice. Era Capitano di I classe nella Marina mercantile di Genova.
Nel 1860 partecipò alla spedizione dei Mille. Alla battaglia di Calatafimi fu ferito alla gamba sinistra. Fu sottotenente e poi capitano di Stato Maggiore e aiutante di campo del generale Garibaldi. Ebbe le medaglie commemorative e la pensione dei Mille e una medaglia d’argento al valor militare.
Alla fine della campagna dei Mille Niccolò Ottone passò nell’Esercito regolare raggiungendo il grado di maggiore. Il 23 Ottobre 1864 congedato d’autorità e si diede nuovamente alla navigazione nel 1878 risultava capitano marittimo.
Si stabilì a Portici dove morì il 4 luglio 1901.